biopython Python计算分子生物学工具
biopython简介
biopython,Python第三方库,生物信息学工具,包括用于各种生物信息学文件格式(BLAST、Clustalw、FASTA、Genbank等)的解析器、在线服务访问(NCBI、Expasy等)、常见和不常见程序的接口(Clustarw、DSSP、MSMS等)、标准序列类、各种集群模块、KD树数据结构等。
biopython应用实例
>>> from Bio.Seq import Seq
>>> my_seq = Seq("AGTACACTGGT")
>>> my_seq
Seq('AGTACACTGGT')
>>> print(my_seq)
AGTACACTGGT
>>> my_seq
Seq('AGTACACTGGT')
>>> my_seq.complement()
Seq('TCATGTGACCA')
>>> my_seq.reverse_complement()
Seq('ACCAGTGTACT')
biopython Github统计数据
Freely Distributable(数据来源:pypi)
Github 3.9k stars
biopython安装命令
pip install biopython
Python版本要求
biopython1.81 Python 3.8+
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